En épocas precolombinas, era el asiento central del reino aimara Lupaca, en el margen occidental del lago Titicaca, Chucuito era su capital y existían otros seis pueblos o cabeceras hacia el sur: Acora, Ilave, Juli, Pomata, Yunguyo y Zepita, los mismos que perduran hasta el presente. Los lupaca eran autónomos aun cuando estaban bajo control Inca, tenían una alianza entre la élite cuzqueña y los Lupaca, así se evidenciaba el grado de autonomía que gozaban. Se estima, del quipu incaico, que el área contaba con 20.000 unidades familiares, aproximadamente, abarcando el área nuclear desde Chucuito hasta el río Desaguadero. Poseía enclaves en las vertientes orientales y occidentales de los Andes, donde se producía coca y maíz, ya que en la zona nuclear resultaba imposible hacerlo por estar a más de 3.800 metros de altitud. En el siglo XVI la provincia de Chucuito estaba constituida por los siete pueblos o cabeceras señaladas anteriormente; sin embargo, Chucuito seguía como sede de la élite político-cultural provincial. Chucuito jamás tuvo encomendero alguno, dado que desde sus comienzos fue un repartimiento en “cabeza de Su Majestad”. Por esa razón, la tributación en productos y servicios, característica de las encomiendas pre toledanas, no tuvo lugar en ese distrito y, en consecuencia, desarrolló una estrategia de supervivencia distinta frente a la tributación y a los curas doctrineros, en relación con las encomiendas de los conquistadores. La historiografía señala una cédula real, fechada el 8 de marzo de 1533, como el origen del repartimiento de Chucuito “en cabeza de Su Majestad”. Durante las visitas de Garcí Diez de San Miguel de 1567, y el general de Toledo de 1574, Martín Cari y Martín Cuxi eran los kurakakuna o mallkus de la provincia. Excepto Juli, que seguía al modelo tripartito Hanan-Urin-Ayancas, el resto de las cabeceras respondían al sistema de bipartición Hanan-Urin, lo que fue ideal para un buen manejo administrativo y social. Las Cajas Reales de Chucuito era una institución en la época del virreinato, fue denominada como Caja Real y así figuraba en diversos informes al Rey, recogía el diezmo minero y otros tributos de la provincia, estaba en la jurisdicción de la diócesis del Cuzco y era reclamada por el Obispo de La Paz. Como efecto de la sublevación de Túpac Amaru y Túpac Catari se llegó a devastar la ciudad de Chucuito. Llegando a incendiar la primera edificación de las Cajas Reales. Pero después de haber sido pacificado el Altiplano y por consiguiente la ciudad de Chucuito, fue reconstruida las Cajas Reales entre 1780 - 1782. Una portada de piedra lleva tallada en alto relieve el año de 1780. La reconstrucción, que fue realizada con mano de obra de los indígenas, comprendía la contaduría, tesorería, vivienda del oficial, fábrica y fundición, además de almacenes de Azogue. También fue construido un fuerte que servía para guardia y custodia de los caudales. Dada la impresionante historia de este pueblo, la ciudad de Chucuito mantiene en sus casonas y fachadas la memoria de su historia y aún quedan pórticos coloniales, con inscripciones que identifican a instituciones religiosas, la Gobernación y Las Cajas Reales con emblemas de leones en las columnas y fechados en 1780, es una ciudad muy tranquila para visitar, además que se encuentran otros recursos turísticos como sus templos coloniales, Inka Uyu, miradores, piscicultura y otros, que pueden ser recorridos a pie.

La plaza principal y calles de acceso, y la Plaza de Sto. Domingo y calles de acceso, como Ambientes Monumentales y Zonas Monumentales fueron declarados Patrimonio Cultural de la Nación, con R.S. N° 505-74-ED del 14 de noviembre de 1974. El Mirador de Chucuito “La Glorieta” como Ambiente Monumental y Zona Monumental fue declarado Patrimonio Cultural de la Nación con la R.M. N° 0928-80-ED del 24 de setiembre de 1980. El 2021, la plaza de armas de Chucuito, obtiene sello internacional "Safe Trave"

Regular. requiere mejoramiento de las vías, y mantenimiento y puesta en valor de sus recursos turísticos.

El 01 de enero en la comunidad de Pirapi (4 kms. al sur de Chucuito) se celebra la festividad del Niño Jesús con actividades religiosas, presentación de danzas con traje de luces y corrida de toros. Cada segundo domingo de octubre durante una semana, se celebra la fiesta patronal de la Virgen del Rosario con un programa variado; celebraciones religiosas, presentación de danzas con traje de luces, venta de artesanías, corridas de toros, platos típicos. El 15 de agosto se celebra la fiesta Patronal de la Virgen de la Asunción con celebraciones religiosas, feria artesanal y comercial.