El Santuario del Señor de Huanca se ubica en el paraje homónimo, distrito de San Salvador, en las faldas del nevado Pachatusan, a una altitud de 3,220 m s. n. m. Arquitectónicamente, el complejo religioso actual es resultado de un proceso constructivo desarrollado entre 1931 y 1965, empleando materiales tradicionales como adobe y piedra, bajo una volumetría de planta rectangular de gran escala y estilo contemporáneo. La fachada principal destaca por una arquería triple de medio punto que jerarquiza el ingreso, donde la puerta central sobresale por sus dimensiones. El conjunto frontal se completa con un campanario de dos niveles, balcones laterales de madera y un reloj ornamental ubicado en el eje simétrico superior. En el interior, el elemento de mayor valor artístico es el Altar Mayor, una estructura barroca de 20 metros de altura por 8 de ancho, tallada íntegramente en madera y revestida en pan de oro. Este retablo de tres cuerpos y tres calles custodia la imagen del Señor de Huanca, una pintura mural ejecutada directamente sobre roca viva en el siglo XVII, que representa la advocación de un Cristo martirizado. La ornamentación del recinto incluye lienzos de la Escuela Cusqueña con pasajes de la vida de San Pedro Nolasco, una imagen de la Virgen de la Merced y un Cristo Crucificado, además de un púlpito de madera tallada de factura contemporánea. La relevancia histórica del santuario se cimenta en dos relatos fundacionales: el primero, de 1675, atribuido al indígena Diego Quispe, quien tras una epifanía en una cueva local motivó a la Orden Mercedaria a encargar la pintura de la visión sobre la roca sólida. El segundo, de 1778, refiere la sanación del ciudadano boliviano Pedro Valero por un médico místico cuya fisonomía coincidía con la imagen del Cristo de la roca, consolidando la fama del recurso como el “Médico de los Pobres”. En el ámbito socio-cultural, el santuario constituye el eje de una de las peregrinaciones más importantes del sur andino, cuya festividad central se celebra cada 14 de septiembre. El flujo de visitantes se canaliza por dos vías principales: una ruta de peregrinación peatonal de carácter penitencial que atraviesa San Jerónimo, la comunidad de Huaccoto y el Abra Atoq’asa; y una ruta vehicular vía Huambutío. Además de la liturgia tradicional, el santuario mantiene una dinámica constante durante el año, vinculada a ritos de bendición de vehículos y bienes muebles con agua bendita, integrando la fe religiosa con las costumbres locales contemporáneas.

La Escuela Cusqueña sobre soporte pétreo constituye un caso singular dentro del arte colonial. Diversos estudios especializados en historia del arte, como los publicados por el Instituto de Investigaciones Estéticas de la UNAM y la Universidad de Sevilla, destacan al Señor de Huanca como un ejemplo atípico de pintura mural realizada directamente sobre roca viva. A diferencia de otros santuarios donde la imagen se presenta en forma de escultura o lienzo, aquí la particularidad radica en la aplicación de la técnica de fresco o temple sobre el afloramiento rocoso del cerro Pachatusan. Este procedimiento artístico se vincula con los procesos de extirpación de idolatrías, en los que se buscaba cristianizar antiguos espacios sagrados andinos —huacas—, transformándolos en lugares de culto católico.

Declarado Patrimonio Cultural de la Nación la Festividad y peregrinación al santuario del Señor de Huanca, mediante la Resolución Nº 126-2014 del Viceministro de Patrimonio Cultural del Ministerio de Cultura.

Su estado de conservación es bueno, ya que el conjunto arquitectónico del Santuario mantiene su integridad estructural y funcional, evidenciando procesos de mantenimiento constante en sus instalaciones a cargo de la Orden Mercedaria y la Dirección Desconcentrada de Cultura

El recurso posee una relevancia que trasciende fronteras nacionales, siendo catalogado por el antropólogo Michael Sallnow (1987) como un culto regional de alcance transnacional. Su advocación como 'Médico de los Pobres' es un fenómeno de sincretismo documentado en la Revista Española de Antropología Americana, destacando su poder de convocatoria en peregrinos provenientes de Bolivia, Argentina y Chile, lo cual justifica su importancia como eje de turismo religioso en el Cono Sur.