La Iglesia Nuestra Señora de la Misericordia posee valor histórico por constituir un documento físico de la arquitectura religiosa establecida a raíz de la organización de la población indígena de Jequetepeque en reducciones a finales del siglo XVI, las cuales fueron dotadas de instituciones tales como doctrinas o curatos con iglesia. Presenta asimismo valor arquitectónico, definido por su fachada, en la que resalta su campanario de sección octogonal y su portada de ingreso, elementos que representan un testimonio de la adopción del estilo barroco en la edificación de arquitectura religiosa durante el virreinato del Perú. Su valor tecnológico se manifiesta en el sistema constructivo de sus muros de adobe con contrafuertes, el cual se ha conservado. Asimismo, en la cobertura de su nave, la estructura de arcos formeros de madera con correas de cuero, cubiertos al interior por caña de Guayaquil y yeso, y por fuera por caña brava, torta de barro y cal, sistema constructivo que ha sido retomado para su reconstrucción contemporánea. El origen de su nombre proviene debido a un milagro que hizo la Virgen cuando una epidemia arrasó y mató a muchos pobladores del distrito, quienes imploraban misericordia. Sus súplicas fueron escuchadas y desde entonces se venera y se rinde homenaje a la Santísima Virgen de la Misericordia. En 1890 la Arquidiócesis de Trujillo designó a la parroquia Pacasmayo como cabeza de la doctrina de Jequetepeque. En el año 2016 estuvo en restauración el techado de la iglesia, hasta la actualidad existe un comité pro templo en aras de la conservación del mismo.

Es la única construcción de estilo Barroco en el distrito de Jequetepeque.

Mediante la Resolución Viceministerial Nro. 110-2016-VMPCIC-MC fue declarada Patrimonio Cultural de la Nación.

Buen estado de conservación, el comité Pro- Templo está a cargo de su mantenimiento y realiza diversas actividades y gestiones para su reposición, restauración y conservación.