Fue fundado por el Padre Miguel Coquelet de Ayaviri y luego, por Michaela Novotna, gestora patrimonial y cultural. Su existencia como un espacio para el público inicia en 2014, como un humilde taller de restauración de bienes muebles en la parroquia. Del taller de restauración surgieron las salas de exposición, espacios públicos y recorridos escolares, hasta que gracias a los fondos del Ministerio de Cultura y el apoyo de algunas empresas, logró ser el centro cultural multifacético, vivo y dinámico hasta la actualidad. El primer paso fue restaurar la gran catedral de piedra de Ayaviri, y mientras se desarrollaba el proyecto, se empezaron a intervenir algunas obras de arte rescatadas. El taller pequeño atrajo visitas escolares, el mismo que inspiró una exposición pública sobre la restauración, posteriormente se instaló en a la Prelatura de Ayaviri para abrir un museo. En 2015, el Centro Cultural San Juan Pablo II apertura un museo interpretativo con salas enfocadas en distintos patrimonios de la siguiente manera: a) Memoria en los Andes: se exhibe a través de la página web y paneles en la calle peatonal b) El Arte de la Restauración - La Materia y lo Sagrado: Se detalla el estado de arte religioso de la región Puno, sus amenazas, el olvido, la fuerza de la devoción y la cultura viva que las protege. c) Ayaviri Litúrgico: en esta sala se encuentra los objetos litúrgicos, desde la platería hasta la vestimenta sagrada de la época colonial en la ciudad de Ayaviri. d) La K’ajcha, del tambor al pinkillo: se exhibe las danzas más emblemáticas de los distritos de la provincia de Melgar, desde las palabras, experiencias directas de los músicos, bailarines y cantantes. e) Nos Vemos en la Moya: Es una exposición de rescate de conocimientos de la reserva ecológica, desde lo histórico, arqueológico, mitológica y ecológico. El Centro Cultural San Juan Pablo II, ofrece a toda la Región Puno, el único, taller de conservación y restauración de bienes culturales como las pinturas de caballete y esculturas policromada. No solo se conserva y restaura en el taller si no forma del parte del guiado del museo. El visitante puede apreciar y participar con los técnicos durante las labores de restauración de las pinturas e imágenes que traen desde diferentes partes de la Región de Puno.

El taller de Restauración y conservación es único en la región de Puno, se restaura bienes culturales como pinturas de caballete y escultura policromada.

Bueno, La prelatura de Ayaviri realiza permanente mantenimiento.

Ubicado en la ciudad de Ayaviri, Pasaje peatonal 25 de Diciembre N° 260.