El edificio donde funcionaba la Aduana de Paita se encuentra ubicado en la Av. de la Merced de Paita. No existe una documentación que atestigüe su fecha de creación, pero se tienen referencias de la primera Aduana en Paita por la expedición chilena que invadió esta ciudad y procedió a incendiar los locales públicos entre los que se encontraba la Aduana, que según estos relatos estaba construida de hierro y madera, tenía una torrecilla donde se podía izar el pabellón nacional y contaba también con un reloj. Tras esta desgracia y por la importante labor que desempañaban al recaudar impuestos para el fisco, fue reconstruida en 1895, en el Gobierno de Nicolás de Piérola, en su actual ubicación frente al Muelle Fiscal, y el año 1987 fue declarada Patrimonio Histórico-Artístico de la Nación. Posteriormente, el año 2002, la Superintendencia Nacional de Aduanas se la cedió al INC para su Conservación y Mantenimiento. Es una antigua edificación colonial y republicana del siglo XIX, de propiedad de la Superintendencia Nacional de Aduanas. Fue local de la antigua Escuela Náutica, en la que estudio Miguel Grau. De estilo Ecléctico de los fines del Siglo XIX; utilizado para el control del comercio internacional, el cual desempeñando un papel de trascendencia en el crecimiento y desarrollo económico del país y la Región en la Época Republicana.

Ser la única edificación de estilo ecléctico en la Región.

fue declarado Patrimonio Cultural de la Nación en 1987.

Mal estado.