El pueblo de Muqui, anteriormente formaba parte del distrito de Muquiyauyo y este último pertenecía a la doctrina de San Miguel de Huaripampa. Antiguamente, su territorio fue ocupado por la etnia de los “Shawshas” como lo demuestran los vestigios de los sitios arqueológicos de Pariawanka, Palala y Cutu Cutu; a la llegada de los Incas fueron anexados al Chinchaysuyo y formaron parte de la parcialidad de Hatun Xauxa. Con la invasión española, se constituyó como una reducción de las poblaciones prehispánicas aledañas, siendo anexo de la doctrina de Huaripampa. Durante la colonia fue escenario de diversos conflictos por el control y posesión de las tierras entre los diferentes grupos sociales, situación que fue empeorando hasta alcanzar el colapso del sistema colonial, principalmente a finales del siglo XVIII e inicio del siglo XIX, hecho que dio lugar a las gestas libertadoras en la que Muqui y las poblaciones aledañas se organizaron bajo el liderazgo del Coronel muquiyauyino Bruno Terreros Baldeón quien respaldó la “Campaña de la Independencia” entre los años 1820 y 1824 teniendo cercana coordinación con el General Álvarez de Arenales. Durante la Guerra con Chile, mientras la Campaña de La Breña era organizada por Andrés Avelino Cáceres desde Ayacucho, los pobladores muquinos y pueblos vecinos volvieron a demostrar su patriotismo frente a la invasión chilena en la sangrienta “Batalla de Antoshpampa” en la tarde del 22 de abril de 1882, el mismo día en la que el clérigo Buenaventura Mendoza había sucumbido en defensa de Huaripampa frente a la acometida del ejército chileno dirigido por Estanislao del Canto. Esta resistencia estuvo liderada por Leonor Ordoñez Surichaqui quien tenía a su cargo una columna de guerrilleros conformada por montoneros armados únicamente con rejones, palos, hondas y piedras, preparados para enfrentar a un conjunto de artillería, caballería e infantería de chilenos muy bien armados. Esa tarde fatídica, Leonor Ordoñez parte desde Huancani haciendo una breve parada de reorganización cerca al actual cementerio de Muqui mientras el enemigo se encontraba en el paraje denominado Atishi, en las afueras del actual poblado de Muquiyauyo; apenas divisaron al enemigo, la lideresa dio orden de ataque produciéndose el enfrentamiento en el paraje de Antoshpampa (ubicado en el actual distrito de Muqui). La resistencia patriota fue diezmada, Leonor Ordoñez, que fue cogida prisionera en medio de la lucha, arengó a sus guerrilleros para un último esfuerzo, hasta que el fuego de fusilería chilena selló para siempre sus labios. Tras ello, los pueblos de Muqui y Huancani fueron saqueados y destruidos; sin embargo, esto representó una genuina demostración de patriotismo que posteriormente se capitalizaría con la completa expulsión de los invasores chilenos a través de la Campaña de la Breña liderado por Andrés Avelino Cáceres. Muqui fue reconocido como distrito mediante Ley N° 12333 promulgada el 10 de junio de 1955 durante el gobierno de Manuel A. Odría. Actualmente, el pueblo de Muqui conserva un estilo tradicional en sus edificaciones, que muestran típicos techos de teja a dos agua, tapiales, adobe y técnicas constructivas propios del Ande arraigado a tradiciones milenarias de “ayllu” como el “wajite” o “wallaq” que es un mecanismo de reciprocidad en el trabajo. El pueblo organiza su trabajo a través de 4 cuarteles que forman parte de dos barrios (Barrio Arriba y Barrio Abajo) que se consideran como “El Paraíso de la Jija” ya que es la danza que los representa, también son cultores de la tunantada, el carnaval jaujino y los negritos de Muqui, asimismo es cuna del artista plástico Leo Hilario cuyas obras de arte (Pintura y escultura) se van haciendo cada vez mas conocidas a nivel nacional por lo que el visitante puede visitar su taller ubicado en el Jr. Sucre para conocer sus trabajos e inspiraciones.

Se encuentra en regular estado de conservación, no muestra residuos sólidos visibles debido a la atención que le presta la Municipalidad Distrital de Muqui, sin embargo, algunas de sus construcciones tradiciones que presentan deterioro visible.

Las festividades mas importantes en el pueblo se llevan a cabo entre febrero y marzo donde se lleva a cabo los Carnavales, en el mes de mayo la festividad de las Cruces de Mayo donde se baila la Jija y en el mes de setiembre en honor a la Virgen de las Mercedes, patrona del pueblo, donde se baila la tunantada.