El Museo "Juanita" se encuentra ubicado en el distrito de Cabanaconde, a 15 minutos del Mirador de la Cruz del Cóndor, en el Valle del Colca. La infraestructura consta de una torre de tres niveles, de los cuales actualmente solo el primer nivel se encuentra acondicionado, albergando 06 salas de exposición permanente. La colección está integrada por bienes materiales muebles de valor arqueológico, etnográfico, histórico, fotográfico y bioarqueológico. La muestra presenta un estado de conservación regular, acondicionado adecuadamente para la exhibición del público visitante. Asimismo, se precisa que el museo no pertenece a la Red Nacional de Museos del Perú y no cuenta con un equipo o nombre de curaduría formalmente asignado. La distribución de las 06 salas de exposición se organiza de la siguiente manera: Sala 1: “Paisaje y Fauna” Presenta una exposición fotográfica de 13 paneles de doble cara sobre la fauna silvestre local, destacando 26 especies de aves del Valle del Colca. Se complementa con 06 fotografías de paisajes e hitos turísticos como el volcán Sabancaya, el Mirador de la Cruz del Cóndor y la catarata de Llahuar, además de gigantografías panorámicas tomadas desde los principales miradores del circuito. Sala 2: “Expedición Juanita” A través de 21 paneles fotográficos, documenta el hallazgo realizado por el antropólogo Johan Reinhard y el andinista Miguel Zárate Flores en el nevado Ampato, tras el deshielo ocasionado por la erupción del volcán Sabancaya. Adicionalmente, cuenta con 03 vitrinas que exhiben un quipu inca y 02 cabezas tejidas en fibra de alpaca. Sala 3: “Arqueología Collagua-Cabana” Dispone de 07 muebles de exhibición con piezas únicas de las culturas Collagua y Cabana, entre las que destacan textiles, ponchos, estructuras miniatura de chullpas, silbatos de hueso, fragmentos cerámicos, vasijas, keros y muestras de productos agrícolas ancestrales. Sala 4: “Frutos de la Tierra” Exhibe la diversidad agrícola del Valle del Colca, tales como maíz, papa, chuño blanco, habas, pallares y quinua. Resalta de manera especial la producción del Maíz Cabanita mediante un registro fotográfico del proceso de siembra, cosecha y sus diferentes variedades cromáticas. Sala 5: “Cultura Viva del Valle del Colca” Pone en valor el patrimonio inmaterial y la indumentaria tradicional. Muestra los bordados locales (declarados Patrimonio Cultural de la Nación en 2018) y 05 trajes típicos completos: uno de mujer collagua, uno de mujer cabana, uno de varón, uno de mujer del Valle de los Volcanes y uno de mujer de la Reserva Nacional de Salinas y Aguada Blanca. Sala 6: “Juanita, la Dama del Ampato” Alberga el cuerpo momificado de un niño de pocos meses denominado "Kuski", hallado sentado, vestimentado y con cabello conservado. En el centro, bajo una gigantografía del nevado Ampato, se exhibe una réplica a escala de la Momia Juanita protegida en una estructura de vidrio, la cual recrea fielmente los atavíos y rasgos de la original resguardada en la Universidad Católica de Santa María de Arequipa.

Regular, presenta deterioro en algunas de sus instalaciones. Asimismo, las piezas de exposición no cuentan con un mantenimiento adecuado.

En el segundo nivel del edificio se ha construido una Chinkana, término de origen quechua que hace referencia a túneles o pasadizos subterráneos utilizados en la época prehispánica. Esta estructura bordea el edificio y forma parte de los elementos complementarios del museo, permitiendo recrear de manera simbólica este tipo de construcciones asociadas a la cultura andina.