Se encuentra en la plaza mayor del distrito de Huaro, provincia de Quispicanchi al sur de la región del Cusco, Construida a fines del siglo XVI y principios del XVII por la Congregación Jesuita Española, la iglesia de San Juan Bautista de Huaro se erige con una mezcla de materiales como piedra, adobe y techos de tejas. Su imponente campanario, tipo espadaña, de tres niveles y seis campanas, se destaca en la fachada. En su interior, se pueden admirar cuadros de la escuela cusqueña, debidamente restaurados, con marcos tallados y recubiertos con pan de oro. El templo presenta un estilo renacentista y alberga más de 60 esculturas y 50 lienzos de gran calidad, además de platería, retablos y otros bienes muebles de un valor artístico incomparable. Uno de los elementos más sobresalientes de la iglesia es su artesonado mudéjar del presbiterio, hecho con casetones de madera, así como su retablo mayor, una pieza de madera tallada y sobredorada con pan de oro, de estilo barroco, construida en el siglo XVII por Martín de Torres. En el atrio y las escalinatas del templo, se pueden apreciar numerosos petroglifos de estilo precolombino, finamente tallados en sillar y piedra, que combinan motivos andinos y cristianos. La iglesia también es conocida por sus impresionantes pinturas murales que cubren la totalidad de los techos y paredes. En una primera fase, en el siglo XVII, artistas locales crearon imágenes con el fin de difundir el evangelio y simbolizar la fusión de creencias indígenas y coloniales. Durante el siglo XVIII, la decoración se extendió hasta el cielo raso, las bóvedas, las columnas y los muros. A principios del siglo XIX, el pintor cusqueño Tadeo Escalante realizó las últimas pinceladas. Estas obras destacan la simbología andina y colonial, representando las postrimerías del ser humano, tales como el viaje hacia la muerte, el juicio final, la gloria y el infierno. Las pinturas fusionan la espiritualidad indígena con las creencias coloniales, reflejando los programas evangelizadores utilizados en la época. El resultado de más de tres siglos de decoración es una iconografía única que cubre casi todas las paredes del templo, donde cada elemento es distinto. Entre los motivos más destacados se encuentran las escenas del Nuevo y el Viejo Testamento en el sotocoro, las imágenes de arcángeles, representaciones de la flora y fauna en el techo, así como figuras de santos en los frisos. Tras importantes trabajos de restauración realizados en los últimos cuatro años, la iglesia de San Juan Bautista ha resurgido como una joya arquitectónica y uno de los principales atractivos turísticos del Valle de Huaro. Gracias al esfuerzo de un equipo destacado de restauradores, el templo ha recuperado su esplendor. La restauración fue promovida por el World Monuments Fund Europe (WMF) y el Ministerio de Cultura, y se ha convertido en una pieza clave de la Gran Ruta del Barroco Andino. Hoy, sus paredes exhiben nuevamente la variada iconografía que las adorna, y sus retablos han recobrado la belleza que los caracteriza.

Fué declarado como Patrimonio Cultural de la Nación el 28 de Diciembre de 1972 con R.S.Nro. 2900-72-ED. Forma parte de la lista indicativa cultural Templos Rurales Cusco del año 2019 por los criterios II Y IV para Unesco.

Se encuentra en muy buen estado de conservación, ya que la Asociación SEMPA se encarga de su cuidado y administración mediante la Ruta del Barroco Andino.

Cuenta con el distintivo de accesibilidad TUR4ALL de accesibilidad, otorgado por MINCETUR e IMPULSA IGUALDAD el 05 de mayo del 2025. https://www.tur4all.com/resources/templo-san-juan-bautista-de-huaro