Se ubica en la zona fronteriza, limitando por el oeste y el norte con Ecuador, por el este con la Reserva Comunal Huimeki y por el sur con la Reserva Comunal Airo Pai. Está rodeado por los ríos Lagartococha, Gueppí, Peneya y en su interior discurre el río Anusilla. Los suelos generalmente son profundos, de baja fertilidad natural, ácidos y con baja saturación de bases, lo cual indica que su ámbito mayormente es de capacidad forestal y de protección. Además, presenta paisajes de llanura de inundación, paisajes de colinas y terrazas altas, que albergan una amplia diversidad de flora silvestre. Los bosques del Parque Nacional Güeppí-Sekime albergan una gran cantidad de especies forestales y de fauna silvestre, de las cuales algunas se encuentran en la lista de categorización de especies de fauna silvestre amenazadas o son endémicas de la zona. En esta área se han registrado 627 especies de flora que pertenecen a 465 géneros y 119 familias. Entre algunas de las especies amenazadas que han sido registradas en esta área se encuentran: el palo de rosa, el naranjo podrido, el aceite caspi, el cedro, la palma de goma, la lupuna, entre otros. En cuanto a su fauna, en esta área natural protegida se han hallado 97 especies de mamíferos, 417 de aves, 48 de reptiles, 45 de anfibios y 17 de peces. Entre algunas de las especies amenazadas encontradas en esta área se tiene al armadillo gigante, el oso hormiguero gigante, el otorongo, la nutria, el manatí, el delfín rosado, la taricaya, especies nuevas para el Perú, el hormiguerito piojito que mide en promedio 10 cm de longitud y cuyo hábitat natural es la canopia de las selvas húmedas tropicales de las regiones bajas; y el tero común que habita en gran parte de América del Sur. En cuanto a la flora, en esta área se han registrado 627 especies pertenecientes a 456 géneros y 119 familias. Entre las especies más representativas en la zona encontramos el camu camu que abunda en el sector de Lagartococha y que actualmente se industrializa en el ámbito regional; y las palmeras como el aguaje y el huasaí que están presentes en la mayoría del área. El Parque Nacional Gueppí-Sekime presenta una precipitación promedio anual de 2,800 mm. La temperatura media anual de 24,7 °C, con temperaturas medias mensuales que oscilan entre los 23,7 °C a 25,5 °C. Las temperaturas más bajas se presentan durante los meses de junio y julio, donde ocurren los mayores niveles de precipitación; mientras que las mayores temperaturas se presentan de noviembre a febrero, meses en que se registran los menores niveles de precipitación.

Decreto Supremo Nº 006-2012-MINAM: Se establece el Parque Nacional Güeppí – Sekime (2012)

Bueno, protegida por el SERNANP

En este sector se han encontrado restos arqueológicos de culturas preincas que nos pueden proporcionar valiosos datos sobre la ocupación humana de esta zona. En la actualidad esta región es habitada por las comunidades nativas Kichwas, Secoyas y Boras.