Museo ubicado a pocas cuadras de la plaza de armas de la ciudad de Moyobamba, inaugurado el 27 de julio de 1997, siendo uno de los primeros de la Amazonía peruana y que actualmente forma parte de la Red de Museos del Ministerio de Cultura Cuenta con 09 salas de exhibición de muestras arqueológicas, etnográficas e históricas representativas de los primeros testimonios de los hombres y mujeres que poblaron la Amazonía, principalmente la región San Martín. La primera sala expone la cosmovisión ancestral y la vida cotidiana Awajún, mediante paneles, esculturas y piezas de artesanía. La segunda sala es un homenaje a las vivencias y mitos de la etnia Kichwa que se ha asentado al noreste de la región, con carteles y evidencias materiales del colorido de sus tradiciones y costumbres. La tercera sala está compuesta por gráficos y piezas que representan a la etnia Shawi, complementando así la representatividad de estos grupos humanos y la relevancia en la historia regional. La cuarta sala muestra la importancia del Parque Nacional del Río Abiseo, declarado como Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO, donde se exhibe la exuberante flora y fauna endémica, así como las réplicas de los vestigios arqueológicos que aparecieron en la zona desde hace 6,000 años a.C y culmina con la nación Chachapoya. Esta sala guarda estrecha relación con la quinta y sexta, porque permite conocer a detalle el legado cultural de algunos de los 36 sitios arqueológicos del parque, entre los que destacan “Los Pinchudos” y “El Gran Pajatén”, con construcciones que poseen una decoración arquitectónica singular, además, objetos de guerra, báculos, textilería y fardos funerarios. La séptima sala relata el “Encuentro de culturas”, en referencia a la presencia de los primeros españoles en el territorio indígena, cuya historia se cuenta en la octava sala donde se aprende sobre el arte y la ritualidad del pueblo de Chazuta, cuyo legado de alfarería y tejido se muestra vigente a través de esculturas de mujeres artesanas y las urnas funerarias. La novena y última sala es un ambiente para conmemorar la historia y el arte contemporáneo, en referencia a las costumbres que hoy persisten y que se celebran de forma cotidiana y organizada, así mismo, reliquias cinematográficas, religiosas y galería de fotos de acontecimientos de la ciudad de Moyobamba en el contexto del siglo XX. El conjunto arquitectónico y cada una de las piezas se encuentran en buen estado de conservación, pues hace algunos años se realizó la curaduría a cargo del restaurador Donald Gutiérrez Espinola. De forma complementaria, los visitantes acceden a zona amplia de descanso y apreciación de murales amazónicos de la autoría de artistas contemporáneos de la ciudad de Moyobamba y otras regiones, así como la biblioteca departamental con cuantiosa literatura amazónica y folclórica. El museo es un espacio que motiva a los ciudadanos y a los visitantes a conocer los recursos arqueológicos y folclóricos de las comunidades indígenas y las evidencias prehispánicas de la región San Martín, potenciando el turismo cultural y la identidad local.

Reconocido con el Sello Internacional Safe Travels en el año 2021.

Bueno, de encuentra conservado y administrado por la Dirección Desconcentrada de Cultura de San Martín.

Sus objetos arqueológicos se encuentran registrados en el Registro Nacional de Bienes Muebles del Ministerio de Cultura.