Huancané fue uno de los asentamientos importantes a la llega da de los españoles, ciertas fuentes señalan que la construcción de su templo se inició en 1700, y concluido el 12 de octubre de 1722, aunque las características del artesonado mudéjar que aún se nota, indicaría que fue construido con anterioridad a mediados del siglo XVII, manteniéndose el buen estado hasta fines de ese siglo. En 1780 con el levantamiento de Tupac Amaru, Vilcapasa incendio Huancané, que obligo la migración de sus habitantes. En 1849 el padre Leoncio Barrionuevo repara el templo remendando las paredes de adobe y el retejado. En 1852 se informaba que se encontraba en completa ruina desde el Altar Mayor a la puerta, el techo destrozado y las paredes rajadas. En 1900 se encontraba sumamente deteriorado por acción del tiempo, por loque se dispone la venta de la platería para su reparación. En 1901 se rehízo la torre, se revocó la portada de piedra, y se reparó la capilla de la Inmaculada. Entre 1902 a 1910 se derribó la pared del Presbiterio, se rehízo la gradería, se compuso el pulpito y se retejo el templo. Entre 1912 y 1918 se realizaron varias obras, se reparó 46 imágenes, arreglo de la platería, rearmado y arreglo de retablos. En 1928 Romero decía que el pueblo tiene solo dos calles largas, 50 casas o menos , y se elevan dos majestuosos templos. Su construcción hasta el día de hoy presenta un atrio cerrado con una portada de piedra lisa de decoración simple, de piedra, adobe y techo de teja, dos torres, su notable altar de estilo churrigueresco tallado en madera cubierta con pan de oro, cuenta con varios cuadros inspirados en la escuela cuzqueña. Las características especiales del templo en esta parte del altiplano, las actividades religiosas únicas y sus danzas autóctonas, generan la llegada y satisfacción de los visitantes.

Fue declarado Patrimonio Cultural de la Nación por el Instituto Nacional de Cultura mediante R.S. Nº 2900-72-ED, el 28 de diciembre de 1972.

Regular, son necesarias acciones para su puesta en valor.

Se ubica en la plaza de Armas de la ciudad de Huancané, a 3,841msnm. Como templo principal de la provincia de Huancané, en él como otras celebraciones, cada 3 de mayo se celebra la fiesta patronal de la Santísima Cruz de Mayo.