Choquemarca se ubica en la zona alta de la quebrada Cocón, a un par de kilómetros al sur de la laguna del mismo nombre. Destaca por su ubicación geográfica y disposición arquitectónica, ocupa un espacio de 3.22 ha de área construida; presenta doble muralla perimetral en la zona norte, al presente llega a medir hasta 4.5 m de alto, siendo posiblemente mucho más altas en su época de esplendor ya que se encuentran adosadas a edificios de planta cuadrangular, dándole un aspecto más imponente a las murallas. Estos edificios de planta cuadrangular posiblemente hayan tenido una función funeraria, pues en la parte superior presentan una ventana de forma semitrapezoidal, la cual es una típica disposición de los edificios funerarios de esta región, en su interior existe evidencia de restos óseos humanos. Hacia el lado este, el sitio cuenta con una defensa natural ya que esta flanqueado por precipicios que superan los 100 metros de altitud que se extienden de norte a sur. El sitio, al estar asentado sobre una colina elevada, constituye un mirador natural hacia el valle donde se ubica el Centro Poblado de Calca. Desde este punto se observa un sistema ordenado de terrazas artificiales de dimensiones variables, que conforman terraplenes aptos para la construcción. Sobre estas terrazas se ubican varias decenas de edificios de planta circular con muros a doble hilera de rocas unidas con argamasa de barro rojizo, cuyas alturas de las mejor conservadas oscilan entre los 2.1 y 2.3 m con un diámetro de 2 a 5.5 m, algunos de estos edificios en su interior poseen nichos u hornacinas además de contar con vanos de acceso de forma semitrapezoidal de 0.80 m de alto aproximado; la gran mayoría de edificios se asocian a patios de forma rectangular, siendo esta una disposición arquitectónica característica en los asentamientos tarama (Intermedio Tardío, de 1000 d.C. a 1450 d.C.). La presencia de un sistema de terrazas arqueológicas cultivables, claramente definidas en la zona noreste del asentamiento y que se extienden entre 200 y 300 m hacia el río Palcamayo, permite deducir que los habitantes de Choquemarca se dedicaron a dos tipos de agricultura. El primero corresponde a la agricultura de altura, desarrollada en las colinas cultivables ubicadas al noreste del sitio, en tierras situadas por encima de los 4 000 m s. n. m. El segundo tipo de agricultura se habría desarrollado en las terrazas cultivables ubicadas al oeste, donde se practicaba la agricultura característica de la zona quechua (3 200 m s. n. m.). La actividad ganadera habría complementado esta economía, ya que al noroeste del sitio se identifican algunos basamentos de corrales, actualmente muy deteriorados, aunque aún distinguibles desde zonas elevadas. Desde este sector, la zona de pastoreo se habría extendido hacia las punas situadas al norte de la quebrada Cocón, donde se registran amplias pampas y abundantes recursos hídricos, como bofedales, puquiales y la laguna Cocón. Al igual que otros asentamientos ubicados en la zona, los habitantes de Choquemarca, habrían llevado a cabo intercambios comerciales con otros asentamientos del valle de Palcamayo como Anashpata, Huagapo y Yaumanpata ubicados al nortoeste y con aquellos ubicados al sureste como Yanamarca y Pichqamarca; Huarimarca y Vilcabamba. Según la Memoria Descriptiva del Estudio Arqueológico del Departamento de Junín (2015), Choquemarca es un sitio categorizado como zona arqueológica monumental por su alto valor científico, sociocultural y gran potencial para el desarrollo económico y turístico de la zona, destacando por su estado de conservación, particularidad y demás atributos propios del sitio. Este sitio es un excelente mirador natural hacia los paisajes altoandinos de Palcamayo, Acobamba y las cadenas montañosas sagradas para la cultura Tarama como son el Apuhuayhuay o Huayhuayvilca, Chontahuayhuay y Shullcahuayhuay que claramente se observan hacia el sureste del asentamiento.

Declarado como Patrimonio Cultural de la Nación mediante Resolución Directoral Nacional N°677-INC del 16 de setiembre de 2003.

Su estado de conservación es bueno, es uno de los pocos sitios arqueológicos que cuenta con murallas bien conservadas. La mayoría de sus construcciones interiores son visibles, sin embargo, se evidencian algunas zonas donde se ha realizado huaqueos.

En el lugar, ocasionalmente se observa la presencia del venado y zorro, aves como el cernícalo, anka o águila andina, huaychao y otros. Plantas medicinales como la chilca o asmachilca, huamanpinta, árnica y otros.