La construcción data del siglo XVII y fue conocida inicialmente como Hacienda Guerrero, por su primer dueño Juan Guerrero, y se desarrolló a través de una planta cuadrangular de un solo nivel, la comunicación entre los diferentes ambientes era mediante conexiones internas y no había un patio interior, aunque sí tuvo un patio central exento. Albergó diversas actividades complementarias a la residencia de los propietarios, tales como sociales, culturales y religiosas. De esta forma, se explica las grandes dimensiones de los ambientes, la diversidad de espacios y la altura de los mismos. Dentro del edificio se distribuyen y se compartimentan, de acuerdo a su función, los diferentes ambientes. Los dormitorios proporcionaban un espacio de distribución interior, mientras que los ambientes para los trabajadores y el uso común se hallaban en el patio. Mantuvo su esencia hasta que se convirtió en un "cuartel militar" de donde se originó su nombre de "El Fortín" en el siglo XIX. Se delimita el espacio abierto con estructuras amuralladas altas de adobe que recuerda una tapia con almenas y pasarelas en los niveles altos con el propósito de salvaguardar el recinto. En los extremos se ubicaron torres elevadas de planta octogonal con almenas, troneras y una puerta de acceso en arco de medio punto, de las cuales actualmente se encuentran tres. Desde el espacio abierto, se destaca la entrada principal y la galería ancha, que se compone de un arquitrabe o pórtico de madera (entablado) sostenido por seis columnas estriadas de madera pino con bases y capiteles simples que cubre el acceso, al que se accede mediante un puente de ladrillo en arco rebajado (actualmente modificado) y una escalera abierta de mármol. El frontis principal se caracteriza por su estructura simétrico, sobresaliendo los tímpanos en las esquinas. Los vanos de doble altura de las puertas y ventanas, ostentan adornos de yeso y decorados con molduras que simulan almohadillados de piedra al estilo "afrancesado". La carpintería de madera pino, compuesta por portañuelas apersianadas y cerramientos de rejas de fierro y estaño. El vestíbulo recibía a los usuarios con pisos de mosaicos y zócalos de yeso, los vanos de las puertas estaban también decorados con molduras de yeso. Este espacio daba acceso al comedor, dormitorios y pasillos de acceso que conducían a la capilla exenta y al pasillo que conducía a la galería posterior. Todos los espacios albergan molduras en la superficie de los zócalos, y albergan cielos rasos de madera entablada y adheridos a viguetas de madera pino. Se destacan en los pasillos internos las estructuras de madera destinadas a la entrada de luz natural. El comedor, así como los demás espacios, cuenta con una superficie de madera estructurada. Los vanos de las ventanas están compuestos por rejas de fierro de sección circular y bulbos de estaño con portañuelas de madera y vidrio. La capilla se ubica en el costado lateral derecho de la propiedad, ubicada en material de adobe, recordando a las edificadas en otros lugares, y de tipología similar a las del siglo XVII. La nave presenta una portada de pies y una lateral más sencilla, y presenta una portada de pies y una lateral más sencilla. El presbiterio se encuentra en un muro testero semicircular con un claristorio. Contaba con un altillo que delimitaba un espacio similar a un solo coro flanqueado por un arco de adobe de doble arquivolta, sostenido por pilastras adosadas de sección circular. La única nave se encuentra compuesta por tres altares laterales por lado, destacando de manera nítida la del presbiterio. El Fortín de Carabayllo ostenta valor histórico por haber alojado al Ejército Libertador de José de San Martín en la Independencia del Perú; además de su imponente arquitectura, que atrae a los visitantes.

Declarada patrimonio cultural de la Nación, mediante R.M. N° 0928 -802-ED, el 23 de julio de 1980.

Regular, el mantenimiento es realizado por la Municipalidad de Carabayllo, junto a las campañas de limpieza y cuidados del grupo de voluntarios "Guardianes y Defensores del Fortín".

El ingreso es a través de la Panamericana Norte por el ovalo Puente Piedra (distrito Puente Piedra) donde se tiene que tomar la av. San Juan que kilómetro y medio más adelante cambiara por el nombre de av. José Saco Rojas.