El templo de San Pedro Apóstol de Andahuaylillas está ubicado en la Plaza de Armas del distrito de Andahuaylillas, provincia de Quispicanchi, en la región del Cusco. Conocido popularmente como "La Capilla Sixtina de América", es de estilo barroco andino con una fachada renacentista. Su construcción comenzó a finales del siglo XVI, sobre los restos de una pequeña capilla que, a su vez, se erigió sobre un antiguo templo inca, del cual aún se conservan las bases de piezas líticas finamente trabajadas. El templo presenta una sólida construcción con cimientos de piedra y muros de adobe reforzados con contrafuertes exteriores. Las naves, alargadas y estrechas, muestran elementos de arte mudéjar en el uso de ladrillos en la portada y arcos, así como alfarjes y lacerías de madera en los techos artesonados. La influencia renacentista se evidencia en el clasicismo de sus portadas, con un arco de triunfo romano y archivoltas destacadas en el vano central, además de la pintura mural. El diseño del templo es de una sola nave rectangular con cuatro capillas situadas a los lados del presbiterio de testero plano. Incluye un recinto bautisterio y una base de torre única en el lado de la epístola. Los muros laterales presentan prolongaciones de contrafuertes que enmarcan la portada, el retablo y el balcón. Tanto en la nave como en la torre, se observan numerosas piezas líticas de la época incaica, reutilizadas como base para los cimientos y los muros de adobe. El arco triunfal del templo exhibe una pintura mural de la Virgen Reina de los Ángeles, mientras que la capilla mayor, con su retablo principal y techo artesonado, transmite una impresión de grandiosidad. La armadura de tres paños del falso techo interior, que data del siglo XVII, tiene vigas en relieve decoradas con rombos ornamentados con hojas. Esta armadura, de tradición mudéjar, es un preámbulo al extraordinario alfarje ochavado situado sobre la capilla mayor. Todo el conjunto está policromado, destacándose las tiaras y llaves pintadas que simbolizan la advocación a San Pedro Apóstol. En el coro alto se encuentran dos órganos del siglo XVII, construidos en Cusco y considerados los más antiguos de Latinoamerica, construidos entre 1606 y 1620, en los que por vez primera se toco la primera composicion polifonica. ambos en funcionamiento. En el sotocoro, sobresale el fino trabajo de madera del sofito. La galería cuenta con vigas decoradas que forman un artesonado policromado con ornamentos florales y listones revestidos en pan de oro, enmarcando pinturas posteriores que ilustran el martirio de San Pedro y San Pablo. El templo de San Pedro Apóstol, siguiendo las características de las iglesias doctrinales, buscó llevar la doctrina católica a los espacios públicos mediante plazas sacralizadas con capillas posas, donde se detenía el Santísimo Sacramento durante las procesiones, y con la creación de una galería elevada o balcón abierto para predicar y oficiar misa a los fieles reunidos en el atrio y la plaza mayor. El altar mayor, de dos cuerpos y tres calles, está tallado en madera de cedro y recubierto con láminas de pan de oro de estilo barroco de mediados del siglo XVII. Las calles, separadas por columnas salomónicas decoradas con uvas, albergan lienzos y esculturas de santos en hornacinas dispuestas simétricamente. Destacan también los retablos del calvario del siglo XVIII, que en la parte frontal contienen uno más antiguo de yeso policromado y de gran valor estético; el retablo de San Pedro, tallado en madera de aliso y cubierto de pan de oro, y otros retablos dedicados a la Virgen de las Mercedes, la Virgen del Carmen y la Sagrada Familia. Entre los lienzos de pintura de caballete de la afamada Escuela Cusqueña, es notable la serie sobre la vida de San Pedro que cubre los muros laterales. Estas obras representan escenas significativas como el martirio de San Juan Bautista, San Pedro huyendo de la cárcel, la conversión de San Pablo y la crucifixión de San Pedro, entre otras.

El templo de Andahuaylillas resalta por su nave decorada con magníficos murales, la mayoría atribuidos a Luis de Riaño y en su interior, cuenta con tesoros de pinturas de caballete de los más importantes artistas del s.XVII. Su artesonado de estilo mudéjar es uno de los más sofisticados del sur andino, sus altares y tallas en madera y en maguey son todas sin excepción magníficas obras de arte. Cabe mencionar también sus dos órganos, los más antiguos de Latinoamérica, construidos entre 1606 y 1620, en los que por vez primera se tocó la primera composición polifónica del Nuevo Mundo, el Hanaq Pachap Kusikuynin, atribuida a Juan Pérez Pérez de Bocanegra, párroco de la iglesia de Andahuaylillas en esos años.

Fue declarada como Patrimonio Cultural de la Nación como Monumento Histórico Artístico por la Ley NRO.13437 con fecha de declaración 02/09/1960 por el Instituto Nacional de Cultura.

Se encuentra en muy buen estado de conservación, ya que la Asociación de SEMPA se encarga del mantenimiento y conservacion continua. Adicionalmente se ha presentado el expediente al Mincetur para calificar al sello de Tur4all- Templo con accesibilidad para discapacitados.